Команда "Торпедо-2" была образована в 2022 году. Первый официальный матч состоялся 17 июля на стадионе "Салют" в Долгопрудном, на домашнем стадионе коллектива в сезоне 2022 - 2023 годов. Чёрно-белые сыграли вничью 0:0 против тверской "Волги".

В начале сезона коллектив возглавлял главный тренер Николай Ковардаев, начавший тренерскую карьеру в 2004 году и поработавший как с молодежными составами различных команд, так и с основными. Но сейчас он переведён в "Торпедо", выступающее в РПЛ.

На данный момент молодыми черно-белыми футболистами руководит Виталий Кулев.

Также в тренерский штаб входит бывший игрок "Торпедо" Олег Ширинбеков, сыгравший за клуб более 150 матчей и запомнившийся болельщикам своей жесткой, бескомпромиссной и неуступчивой игрой в опорной зоне. За работу с вратарями отвечает Александр Подшивалов - обладатель Кубка России сезона 1992 - 1993 годов в составе "Торпедо".

Состав "Торпедо-2" состоит преимущественно из молодых игроков, значительную долю которых составляют воспитанники футбольной системы "Торпедо". Свой первый сезон команда начала сразу во второй лиге - третьей по рангу футбольной лиге России.